防潮濕
碳酸氫銨易吸（xī）濕，造成氮揮發損失；硝酸銨吸濕性很強，易結塊、潮解；石灰氮和過磷酸鈣吸濕後易結塊，影響施用效（xiào）果。因此，這些化肥（féi）應存放在幹（gàn）燥、陰（yīn）涼處，尤其碳酸氫銨儲存時包裝（zhuāng）要（yào）密封牢固，避免與空氣接觸。
防（fáng）揮發
氨水、碳酸氫銨極易揮發，儲存時要密封。氮素化肥（féi）、過磷酸鈣嚴禁與（yǔ）堿性物質（石灰、草木灰等）混（hún）合堆放，以防氮素化肥揮發損失和降低磷肥的肥（féi）效。
防受熱
溫度愈高，化肥的潮解揮發和結塊愈嚴重（穩定性愈差），因此貯存房屋的溫度應保持在30℃以下，農村好不放在有熱源（yuán）的廚（chú）房內。
防火災
硝酸銨、硝酸鉀等有助燃（rán）性，貯存時不能和（hé）易燃物如煤油、汽油、秸稈、木屑等堆放（fàng）在（zài）一起，以免引（yǐn）起火災。
防爆炸
硝酸（suān）銨、硝酸鉀等容易爆炸（zhà），若與銅、鐵等金屬粉末混在一起，一旦摩擦撞擊，就會（huì）引起爆炸事故。所（suǒ）以這些化肥結塊硬化後，嚴禁（jìn）用金（jīn）屬物猛擊，要用重物碾碎。
防腐蝕
過磷（lín）酸鈣有腐蝕性，應防止與皮膚、金屬（shǔ）器具（jù）接觸；氨（ān）水對銅、鐵有強烈腐蝕（shí）性，宜儲存於陶瓷、塑料、木製容器中。此外，化肥不能與（yǔ）種子堆放在一起（qǐ），也不要用化肥（féi）袋裝種子，以免影響種子發芽。
防（fáng）混放（fàng）
化肥有酸性（xìng）和堿性，應分門別（bié）類，按（àn）產地、種類、性質分別放置和保管，以免降低肥效。
防誤用
肥料不能和農藥（yào）、人畜藥品、食用物品（如白糖、食鹽）等混放，以免誤（wù）用。特別要（yào）防止小孩誤食（shí）。